Гистогенетическая диагностика опухолей. Анализ ДНК опухоли.

Обновлено: 17.05.2024

В конце 2018 года швейцарская компания Roche наладила доставку образцов тканей онкологических больных из России в лабораторию в Германии, где проводятся молекулярно-генетические исследования по современной технологии NGS.

В этой статье мы расскажем о том, как в раковых клетках обнаруживают мутации с применением метода NGS, как результаты этого анализа могут повлиять на эффективность лечения, и кому необходимо данное исследование.

Каждый рак уникален

Еще совсем недавно злокачественные опухоли классифицировали только по гистологическому принципу, то есть в зависимости от того, в каком органе они возникали, и как опухолевая ткань выглядела под микроскопом.

С развитием молекулярной биологии и генетики, ученые смогли заглянуть глубже. Изучены многие мутации, приводящие к раку, «неправильные» молекулы, благодаря которым опухоль бесконтрольно растет, поддерживает свою жизнедеятельность, защищается от иммунной системы. Заблокировать эти молекулы и тем самым затормозить прогрессирование заболевания помогают современные таргетные препараты, иммунопрепараты.

Сложность в том, что не существует двух злокачественных опухолей с одинаковыми молекулярно-генетическими характеристиками. Набор мутаций всегда разный, поэтому универсальной «таблетки от рака» нет и быть не может. Для того чтобы назначить эффективное лечение, врач должен понимать, какие мутации есть в опухолевых клетках у конкретного пациента, присутствуют ли в них «мишени» для того или иного препарата.

Для этого и нужны молекулярно-генетические анализы.

Некоторые из генов, связанных с развитием рака, хорошо изучены и постоянно на слуху. Например это мутации EGFR при раке легких, HER2, BRCA1 и BRCA2 при раке молочной железы, BRAF при меланоме.

Американская компания Foundation Medicine, Inc. (Кембридж, США) проводит комплексное генетическое профилирование, во время которого изучают все известные мутации четырех разных классов более чем в 300 генах. Это помогает составить максимально полный «молекулярный портрет» злокачественной опухоли и выбрать наилучшую схему лечения.

В конце 2018 года швейцарская компания Roche наладила доставку биоматериала от онкологических пациентов из России в лабораторию Германии, где есть возможность провести такой анализ. Транспортировка биоматериала проводится в соответствии со всеми требованиями Росздравнадзора.

Мы в «Евроонко» поддерживаем это начинание и считаем его важным шагом в развитии помощи онкологическим больным в России. Если пациенту необходим молекулярно-генетический анализ, наши врачи рассказывают о такой возможности и помогают ею воспользоваться.

Технология нового поколения

Foundation Medicine, Inc. применяет технологию секвенирования нового поколения (англ. next generation sequencing, сокращенно NGS). С ее появлением изучение последовательности всей ДНК человека стало возможным за один день. Методам «первого поколения» для этого требовалось около десяти лет. Технология NGS вывела молекулярную биологию на новый уровень и открыла большие возможности для персонализированной медицины.

С помощью NGS изучают все известные мутации четырех видов:

1. Замена оснований. При этом меняется одна из «букв» генетического кода, что приводит к нарушению структуры белка, кодируемого данным геном.

2. Делеции - утрата определенного участка хромосомы.
Инсерции - когда в гене возникает «лишняя» вставка другой ДНК.

3. Изменение числа генов - увеличение или уменьшение числа копий определенного гена, в результате чего снижается или повышается его экспрессия (активность).

4. Фьюжн - слияние генов, когда из двух отдельных образуется один гибридный.

Кроме того, NGS помогает выявить микросателлитную нестабильность, мутационную нагрузку - количество мутаций на определенный объем генома клеток опухолей.

По завершении анализа врач получает максимально полную информацию о состоянии генов злокачественной опухоли, и эти данные помогают:

Выявить мутации, которые могут повлиять на эффективность лечения, прогноз для пациента.
Подобрать оптимальные схемы терапии.
Узнать, в каких клинических испытаниях может принять участие пациент, если ему не помогают доступные виды лечения.

Услуги FMI

В настоящее время FMI предлагает три вида анализов:

FoundationOne CDx - для солидных (плотных) опухолей. Именно этот анализ применяется в большинстве случаев. Врач проводит биопсию - получает фрагмент опухоли и отправляет в лабораторию. В среднем через 2 недели из лаборатории приходит отчет. Анализируются все рекомендованные гены при солидных опухолях. Исследование микросателлитной нестабильности и мутационной нагрузки помогает в принятии решений по поводу проведения иммунотерапии. Тест FoundationOne CDx одобрен американским Управлением по контролю качества лекарственных препаратов и продуктов питания (FDA), он регулярно обновляется в соответствии с текущими рекомендациями.
FoundationOne Heme - для сарком (злокачественных опухолей соединительной ткани) и злокачественных заболеваний кроветворной системы (лимфом, лейкозов и др.).
FoundationOne Liquid - анализ ДНК опухолевых клеток, свободно циркулирующей в крови. Это наиболее современная технология, так называемая жидкостная биопсия. Для того чтобы провести такой анализ, нужны две пробирки с кровью по 8,5 мл.

Кому необходимо такое исследование?

Тест FoundationOne CDx, как правило, показан на поздних стадиях рака, когда нужно подобрать эффективные таргетные препараты, иммунопрепараты. Тесты FoundationOne Heme могут быть использованы для диагностики заболевания, оценки прогноза, выбора подходящего лечения.

Чаще всего анализ FoundationOne CDx применяют при следующих типах рака:

Немелкоклеточный рак легкого: мутации EGFR, ALK, BRAF.
Меланома: мутации BRAF.
Рак молочной железы: мутация HER2.
Колоректальный рак: мутация KRAS.
Рак яичников: мутации BRCA1, BRCA2.

Какую информацию предоставляет лаборатория по результатам анализа?

Отчет состоит из трех частей. В первой части указаны все мутации, обнаруженные в опухоли у данного пациента, и таргетные препараты, которые будут наиболее эффективны в данном случае:

Таргетная терапия, одобренная для данного типа опухолей с обнаруженными мутациями.
Таргетная терапия, которая одобрена для лечения других типов рака с аналогичными мутациями.
Список клинических исследований, которые могут иметь значение в случае с данным пациентом.

Во второй части отчета представлен литературный обзор с подробными данными об уровне значимости, частоте встречаемости, действии на течение заболевания и возможности использовать тот или иной вид таргетной терапии при выявленных генетических нарушениях. Эта информация регулярно обновляется.

В третьей части отчета указаны клинические исследования, в которых пациент может принять участие.

Анализы FNI уже хорошо себя зарекомендовали на бесплатных образцах по 50 пациентам с раком молочной железы, толстой и прямой кишки, пищевода, желудка, яичников. После тестирования, проведенного компанией Roche, некоторые пациенты, которым не удавалось подобрать таргетные препараты с помощью других методов диагностики, ответили на терапию, составленную в соответствии с рекомендациями лаборатории.

В клиниках «Евроонко» доступны наиболее современные методы диагностики и оригинальные противоопухолевые препараты последнего поколения. Мы знаем, как помочь при запущенном раке, если лечение, назначенное другим врачом, перестало помогать. Свяжитесь с нами.

Диагностика опухоли

Важнейшим условием успешного лечения рака является ранняя диагностика опухоли. Своевременно обнаружив и точно идентифицировав болезнь, можно выбрать оптимальную стратегию борьбы с онкологическим заболеванием.

Первый этап распознавания злокачественной опухоли — консультация врача. Доктор осматривает пациента, проводит опрос, собирает анамнез. Для дальнейшей диагностики опухоли используется комплекс лабораторных и инструментальных методов, позволяющий идентифицировать различные виды онкопатологий. В их числе меланома, рак легкого, толстой кишки, молочной железы, яичников, щитовидной железы и т. д.

Методы диагностики опухолей делятся на инструментальные и лабораторные. К первой группе относятся:

УЗИ (ультразвуковое исследование) — изображения внутренних органов создаются за счет отражения от них УЗ-волн;
рентгенография — получение фиксированных изображений органов при помощи рентгеновских лучей для выявления структурных аномалий костей, сердца и сосудов, органов ЖКТ и легких;
КТ (компьютерная томография) — разновидность рентгенологического исследования, отличающегося более высокой разрешающей способностью и точностью;
МРТ (магнитно-резонансная томография)— методика, базирующаяся на использовании мощного магнитного поля для получения изображений органов. Характеризуется высокой точностью.

Лабораторные методы диагностирования опухоли

Заподозрить рак позволяют различные изменения в клинических анализах крови и мочи. Лабораторные методы диагностики опухолей включают в себя:

клинический анализ крови и мочи, направленный на измерение содержания форменных элементов крови и физико-химических свойств мочи для оценки функционирования внутренних органов;
биохимический анализ крови. Позволяет оценить содержание электролитов, ферментов и продуктов обмена в крови с целью выявления нарушений метаболизма;
иммунологические исследования крови. Направлены на оценку состояния иммунитета, определение количества и состояния иммунных клеток крови, а также присутствие в ней антител;
анализ крови и мочи на белковые онкомаркеры (АФП, РЭА, СА-125, СА-19-9, ПСА и др.) позволяет выявить специфические белки, которые вырабатывают клетки опухоли в процессе жизнедеятельности.

Кроме того, в ранней диагностике опухолей широко используются цитологические и гистологические методы. Первые направлены на оценку характеристик морфологии клеточных элементов в образце для обнаружения онкологических трансформаций. В отличие от гистологических исследований, предполагается изучение не срезов ткани, а непосредственно клеток. Поэтому заключение основывается на особенностях изменения ядра, цитоплазмы и других структурных компонентов клетки. Используется для скрининга, уточнения диагноза, контроля лечения и динамического наблюдения. В качестве материала для цитологических исследований используются биологические жидкости, соскобы, мазки, пунктаты и биоптаты. Цель гистологического исследования состоит в изучении образца ткани, ее структуры, состава, пространственных взаимоотношений между клетками. Путем различного окрашивания можно оценить содержание и локализацию в клетках тех или иных биологических макромолекул: ДНК, РНК, белков. Обработка ткани специфическими мечеными антителами лежит в основе иммуногистохимического (ИГХ) исследования - важнейшего метода определения опухолевых антигенов. Материалом для гистологического анализа может служить биопсийный или операционный материал.

Однако наиболее современными и перспективными, а зачастую и самыми точными методами исследования опухолей являются молекулярно-генетические тесты. В их основе лежит анализ ДНК и РНК опухолевых клеток. Молекулярно-генетические исследования позволяют находить причину заболевания (мутации в генах при наследственном раке) либо выявлять и оценивать различные онкологические биомаркеры, такие как мутации, химерные гены, изменение уровня экспрессии тех или иных генов и т. д.

Назначение молекулярно-генетических тестов:

ранняя диагностика опухоли;
уточнение диагноза;
оценка риска развития онкологического заболевания (предрасположенность к раку, наследственный рак);
подбор эффективной противоопухолевой терапии (фармакогенетика, персонализированная медицина)
мониторинг развития заболевания в ходе лечения.

Материалом для исследования чаще всего служит кровь или ткань опухоли (биоптат, парафиновый блок, свежая ткань опухоли после резекции и другие варианты).

Молекулярно-генетические методы исследований включают в себя:

цитогенетические методы — FISH (флуоресцентная гибридизация in situ) и CISH (хромогенная in situ гибридизация). Применяются для детекции определенных последовательностей ДНК или РНК, позволяют выявлять такие молекулярные изменения, как транслокации и изменение числа копий генов (делеции, амплификации);
ПЦР (полимеразная цепная реакция) в реальном времени - метод, позволяющий детектировать и оценивать количество специфической ДНК или РНК в образце, в т. ч. выявлять мутации, транслокации, изменение экспрессии генов и т. д.;
хромосомный микроматричный анализ — сложная молекулярная технология, позволяющая проводить полногеномный анализ опухоли и выявлять делеции и амплификации отдельных генов и целых участков хромосом;
секвенирование ДНК/РНК — определение их первичной структуры с помощью таких методов, как секвенирование по Сэнгеру и секвенирование нового поколения (next generation sequencing, NGS). Эти методы позволяют определять точечные мутации и небольшие делеции и вставки в опухолевой ДНК;
жидкостная биопсия. Методика базируется на детекции в крови циркулирующих опухолевых клеток или опухолевой ДНК, попадающей в кровь в результате секреции клетками опухоли либо в результате их распада.

В медико-генетическом центре «Геномед» проводится широкий перечень исследований в сфере онкогенетики. Новейшие методы диагностики опухолей позволяют рано выявить заболевание, установить диагноз и назначить наиболее эффективное лечение, что повысит шансы на успешный исход терапии.

Генетический анализ на рак

Генетические анализы на рак - это тесты, которые помогают выявить наследственные (доставшиеся от родителей) и соматические (возникшие в течение жизни) мутации, связанные с онкологическими заболеваниями. Можно выявлять прицельно определенные мутации или проанализировать всю последовательность ДНК, что позволяет обнаруживать до 85% и более генетических нарушений, способствующих развитию злокачественных опухолей.

У здорового человека генетические анализы на рак помогают выявить носительство наследственных мутаций, повышенный риск развития онкозаболеваний и своевременно принять меры по профилактике. У людей с уже диагностированной злокачественной опухолью генетическое тестирование помогает определить подтип новообразования, уточнить прогноз, подобрать наиболее эффективное лечение.

Рак — заболевание, которое ежегодно уносит миллионы жизней, уступая среди причин смертности только сердечно-сосудистым патологиям. Ученые и врачи-онкологи уже давно ведут с ним борьбу, постоянно внедряя новые средства, которые помогают сохранить жизни всё большего числа пациентов. За последние десятилетия поле сражения сильно сместилось с гистологического и клеточного уровня на молекулярно-генетический.

Если раньше было лишь известно, что при раке меняется внешний вид и поведение клеток, то теперь ученые стремятся разобраться в процессах на уровне генов и отдельных молекул. Это стало возможным с развитием молекулярной биологии, и на этом поприще достигнуты немалые успехи.

Каждая клетка человеческого организма содержит около 30 тысяч генов. Среди них есть те, которые контролируют рост и размножение клетки, ее продолжительность жизни, отвечают за «починку» поврежденной ДНК.

Рак развивается из-за мутаций, в результате которых эти гены начинают работать неправильно. Генетические дефекты возникают случайно или при воздействии внешних факторов: курения, ультрафиолетового излучения, канцерогенов в пище и окружающей среде. Некоторые мутации (наследственные) человек получает от родителей, другие (приобретенные) — в течение жизни. [8]

Наследуемая природа злокачественных новообразований доказана для некоторых локализаций. Наиболее часто встречаются рак груди, яичников, поджелудочной железы, толстой кишки, рак желудка и меланома. По различным данным, доля наследственных форм в структуре онкологических заболеваний составляет:

10-17% - Рак яичников. [1]
5-10% - Колоректальный рак. [3]
5-10% - Рак груди. [1]
10% - Рак поджелудочной железы. [5,7]
5-10% - Рак желудка. [7]
5-10% - Меланома. [6,7]

Каждый рак уникален, несет собственный набор мутаций. И эти различия могут сильно влиять на прогноз, чувствительность раковых клеток к тем или иным лекарственным препаратам. Выяснить это помогают специальные генетические анализы.

Что такое генетический тест

Перед тем, как рассказать о генетических тестах, давайте разберемся что такое гены и ДНК. ДНК - это макромолекула (очень большая), которая хранит и передает генетическую информацию. Ген - это участок ДНК, в котором зашифрована информация о белке. Совокупность генов конкретного организма называется генотипом.

Генетические тесты - это очень большой спектр анализов, с помощью которых можно исследовать генотип и отдельные гены человека, а также инфекционных агентов, которые вызывают у него заболевания. Такие исследования нашли широкое распространение в медицине, судебной экспертизе, криминалистике, профессиональном спорте и даже сельском хозяйстве. Наиболее популярные методы, с помощью которых они проводятся: секвенирование, полимеразная цепная реакция (ПЦР), фрагментный анализ и др.

Огромное значение генетическое тестирование имеет и в онкологии, поскольку все злокачественные опухоли являются следствием накопления особых мутаций в клетках организма. А их выявление позволяет поставить точный диагноз, назначить эффективное современное лечение, подтвердить или опровергнуть наследственную природу рака, а также оценить прогноз заболевания.

Выявление наследственных мутаций позволяет разработать план профилактики рака или его обнаружения на ранних стадиях. Например, некоторым пациентам может быть показано изменение образа жизни, в других случаях обсуждается вопрос проведения превентивных операций по удалению органа-мишени, кому-то может быть показано регулярное прохождение углубленного медицинского осмотра, который направлен на выявление опухоли на начальной стадии. [4,8]

Преимущества генетического тестирования в определении предрасположенности к раку

Генетические исследования в онкологии помогают решать важные задачи:

Обнаружить наследственные мутации и оценить риск развития рака, своевременно принять профилактические меры.
Разобраться, есть ли у человека генетические дефекты, связанные с повышенным риском онкологических заболеваний, которые он может передать своим детям.
Составить «молекулярно-генетический портрет» опухоли и выяснить, к каким препаратам она чувствительна.
Устранить беспокойство человека и его родственников, если оно имеется.

Все генетические исследования на мутации, связанные с раком, можно разделить на две большие группы: те, которые проводят у здоровых людей, чтобы выявить риски, и те, которые проводят у онкологических больных, чтобы изучить опухолевые клетки и подобрать правильное лечение. Для каждой группы есть свои показания. Вне зависимости от полученных результатов исследования, необходимо получить консультацию онкогенетика. [4]

Анализы для людей, у которых уже диагностирован рак

Обычно такие исследования назначают при поздних стадиях онкологических заболеваний, когда стандартные методы лечения не помогают. Эти анализы применяют для диагностики заболевания, подбора персонализированной терапии и оценки прогноза.

Наиболее распространенные исследования из этой группы:

При меланоме: исследования мутация в гене BRAF.
При немелкоклеточном раке легкого: гены EGFR, BRAF, ALK.
При раке толстой и прямой кишки: ген KRAS.
При раке молочной железы: ген HER2.
При раке яичников: гены BRCA1, BRCA2.

Эти мутации будут встречаться только в опухолевых клетках. В остальных, здоровых, тканях организма указанные гены будут функционировать нормально. [1,3,5,6,7]

Анализы для здоровых людей, направленные на оценку рисков

Наследственные мутации человек получает от родителей. Они присутствуют в половых клетках, а значит, их получат все клетки тела человека. В настоящее время с помощью генетического теста можно определить повышенный риск развития следующих типов рака:

яичников;
молочной железы;
щитовидной железы;
толстой кишки;
поджелудочной железы;
простаты;
желудка;
почки.

Кроме того, генетические исследования помогают оценить риск меланомы, сарком — злокачественных опухолей из соединительной ткани.

Эксперты из Американского общества клинической онкологии (American Society of Clinical Oncology) рекомендуют рассмотреть возможность проведения генетических исследований на наследственные мутации людям, у которых в семье часто встречались определенные типы злокачественных опухолей, если такой диагноз был установлен у близких родственников. Правильное решение о необходимости обследования помогут принять онколог, клинический генетик. [2]

Что показывает анализ?

Генетические тесты показывают, в каких генах произошли изменения, связанные с повышенным риском рака. Выделяют две группы генов, в которых могут возникать такие мутации.

Протоонкогены кодируют белки, активирующие деление клеток. В норме они должны «включаться» лишь в определенное время. Если в протоонкогене возникает мутация, либо он становится чрезмерно активным (например, из-за увеличения количества копий), он превращается в онкоген, и нормальная клетка становится опухолевой.

Распространенные примеры онкогенов — EGFR и HER2. Эти белки-рецепторы встроены в клеточную мембрану. При активации они запускают цепочку биохимических реакций, в результате чего клетка начинает активно, бесконтрольно размножаться. Все мутации в протоонкогенах — приобретенные, они не наследуются.

Гены-супрессоры опухолей ограничивают размножение клеток, восстанавливают поврежденную ДНК, отвечают за «смерть» отработавших своё клеток. Рак возникает из-за того, что в результате мутаций эти гены перестают справляться со своей функцией. Например, гены BRCA1 и BRCA2 отвечают за репарацию ДНК. При наследственных мутациях в них у женщин повышен риск того, что будет диагностирован рак молочной железы, яичников. [6,8]

«Евроонко» сотрудничает с ведущими зарубежными лабораториями. Они применяют современные технологии секвенирования, которые помогают быстро изучить ДНК человека и выявить изменения в сотнях генов:

замену оснований — «букв» генетического кода;
делеции — утрату участка хромосомы;
инсерции — «лишние» вставки ДНК в хромосомах;
изменение числа копий определенного гена;
фьюжн-мутации — слияние генов, в результате которого образуется новый, гибридный ген;
мутационную нагрузку опухоли.

Какие гены вызывают онкологические заболевания

Как мы уже говорили выше, в образовании злокачественной опухоли имеют значение две большие группы генов: протоонкогены и гены-супрессоры опухоли. Если протоонкоген мутировал и перестал выполнять свою функцию, он превращается в онкоген. Наиболее известные онкогены это HER2/neu - эпидермальный фактор роста, который важную роль в развитии агрессивного рака молочной железы, гены семейства RAS, которые кодируют сигнальные белки, передающие информацию о размножении. Информация о некоторых онкогенах и вызываемых ими злокачественных новообразованиях представлена в таблице:

Протоонкоген	Тип нарушений	Виды опухоли
PDGFB, EGF, TGFA, VEGF, FGFA, FGFB	Гиперэкспрессия либо амплификация	Злокачественные новообразования молочной железы, желудка
PDGFRB, PDGFRA, EGFR, HER2/NEU, RET, MET, ROS, VEGFR	Гиперэкспрессия либо амплификация	Плоскоклеточные злокачественные новообразования, глиобластомы, рак молочной железы и яичников
ABL	Слияние с геном BCR	Острый лимфолейкоз
RAF/MIL, MOS, BCR, PIM1, AKT	Мутации, слияние	Рак желудка, легких, толстой кишки, поджелудочной железы, нейробластома
FOSB, FRA1, FRA2, JUND, BCL3, MYB	Гиперэкспрессия, амплификация	Рак желудка, кишечника, яичников, легких, лимфома Беркитта, нейробластома
BAX, BCL2A, BCL2B	Гиперэкспрессия, транслокация	Фолликулярная В-клеточная лимфома

Наиболее известными генами-супрессорами являются BRCA 1 и 2, которые участвуют в процессах репарации ДНК, p53 - белок, запускающий процесс клеточного цикла и ее гибель при накоплении повреждений ДНК. Также к ним относятся и следующие: [6]

Ген-супрессор	Эффект зародышевых мутаций	Эффект соматических мутаций
Р53	Синдром Ли-Фраумени	Рак толстой кишки, легкого, молочной железы и др.
RB	Ретинобластома	Различные опухоли
p16/INK4A	Наследственная меланома	Рак поджелудочной железы, глиома и др.
ATM	Синдром Луи-Бар	Рак молочной железы, легких, опухоли лимфатической системы
MSH2, MLH1	Наследственный рак толстой кишки и эндометрия	Рак толстой кишки, рак эндометрия
BRCA1, BRCA2	Наследственный рак молочной железы и яичников	Редко мутируют в спорадических опухолях
APC	Семейный аденоматозный полипоз толстой кишки	Рак толстой кишки
PTEN / MMAC1	Болезнь Коудена	Рак эндометрия, простаты, почек, молочной железы, опухоли мозга и др.

Что делать, если мутации выявлены?

В результате проведения анализа пациент получает заключение, в котором представлена информация о проведенных исследованиях. При выявлении одной или нескольких мутаций рекомендуется обратиться к онкологу, генетику или онкогенетику, чтобы составить план дальнейших действий. Он может включать проведение следующих мероприятий:

У пациентов с уже диагностированным раком выявленные мутации помогут подобрать оптимальный метод лечения, в том числе назначение таргетной терапии и иммунотерапии. [1,4,6]

Существуют ли противопоказания?

Генетические тесты могут нести некоторые негативные эффекты. Когда здоровый человек узнаёт, что у него мутация, связанная с повышенным риском рака, это может стать сильным эмоциональным потрясением. Врач порекомендует рассказать об этом членам семьи, чтобы они тоже знали о рисках, и это может сделать семейную атмосферу более напряженной. Сам по себе генетический анализ стоит недешево. Если его проводят у онкологического больного для подбора персонализированной терапии, рекомендованные по результатам исследования препараты тоже могут оказаться очень дорогими.

Как происходит сдача анализа?

Если речь идет о наследственных мутациях, для анализа достаточно сдать кровь из вены. Для составления «молекулярно-генетического портрета» рака чаще всего нужен биоптат — образец ткани злокачественной опухоли. Существует и более современная методика — жидкостная биопсия, когда исследуют ДНК опухолевых клеток, циркулирующую в крови. [8]

Насколько достоверны результаты?

Точность обнаружения мутаций с помощью современных генетических исследований составляет почти 95%.

Что может повлиять на точность результата?

Для того чтобы анализ показал достоверный результат, врач-онколог должен правильно провести биопсию, соблюдать технику фиксации (специальной обработки) ткани. Организация, которая отправляет материал в лабораторию, должна соблюдать правила транспортировки. В противном случае провести исследование не получится.

Расшифровка анализа

Если анализ на наследственные мутации показал отрицательный результат, это значит, что у человека нет генетических дефектов, повышающих риск развития тех или иных злокачественных опухолей. Но это не значит, что он никогда не заболеет раком. Просто его риски несколько ниже. Аналогично положительный результат не говорит о том, что у пациента обязательно будет диагностировано онкологическое заболевание. У него повышены риски, и, возможно, потребуются некоторые профилактические мероприятия.

Иногда результат исследования на наследственные мутации сомнителен. В таких случаях многие онкологи и клинические генетики предпочитают считать, что риск рака всё же повышен, и рекомендуют некоторые меры профилактики. В ряде случаев ситуацию помогают прояснить анализы близких родственников.

Иногда обнаруживают неизвестные изменения в генах. Непонятно, то ли это вариант нормы, то ли нейтральная мутация, то ли она повышает риск рака.

Если анализ проводится у онкологического пациента для подбора эффективного лечения, лаборатория высылает лечащему врачу отчет, в котором указывает:

обнаруженные мутации;
список научных публикаций, в которых эти мутации фигурируют;
препараты, одобренные для лечения рака с такими генетическими дефектами;
препараты, которые в настоящее время не одобрены для лечения данного типа рака, но успешно применяются для борьбы с другими злокачественными опухолями с аналогичными мутациями.

На основе этой информации онколог принимает решение по поводу дальнейшего лечения. [6,8]

Генетические исследования на рак в «Евроонко»

Мы знаем, как помочь, если в другой клинике сказали, что больше ничего нельзя сделать, или лечение, назначенное ранее, перестало помогать. Свяжитесь с нами.

Молекулярно-генетическое исследование опухоли для подбора терапии

Молекулярно-генетические исследования опухоли помогают получить диагностические, предиктивные и прогностические данные для выбора эффективной терапии путем геномного профилирования опухоли. Онкогенотесты позволяют врачу подбирать индивидуальное лечение, диагностировать сложные случаи и предсказать возникновение наследственного рака.

Что определяет метод молекулярно-генетического тестирования опухоли?

Рост клетки контролируется как скорость автомобиля. Ряд генов кодирует молекулы, которые “давят на газ”. При мутации они не прекращают работу, заставляя клетку делиться без остановки. Другие гены кодирует молекулы-“тормоза”, и при их поломке деление клеток, становится неконтролируемым. Молекулярно-генетическое исследование опухоли позволяет обнаруживать такие мутации.

Мутации всегда наследуемы?

Большинство случаев рака вызывается приобретенными в течении жизни мутациями. Их вызывает контакт с, например, сигаретным дымом, радиацией, некоторыми химикатами. Некоторые мутации не имеют чёткой причины и происходят случайно, при делении клеток. Поэтому, даже если человек родился со здоровыми генами, некоторые из них могут измениться в течение жизни. Молекулярно-генетические методы позволяют выявить опухоль на ранней стадии благодаря обнаружению “поломок”.

Почему существует семейная предрасположенность к опухолям?

По современным представлениям, одной единственной мутации в клетке недостаточно. Однако, если пациент уже унаследовал мутацию от родителей, то это ускоряет накопление достаточного количества мутаций для появления злокачественного процесса. Благодаря онкогенотесту возможно узнать о наличии мутации до появления опухоли.

Какие виды исследований ткани опухоли существуют?

Исследования позволяют определить генетический и молекулярный профиль опухоли. Иммуногистохимический тест и флуоресцентная гибридизация in situ (FISH) помогают обнаружить “мутированные” клетки. Генетические тестирования опухоли (ПЦР, секвенирование) применяются для детального анализа последовательности ДНК и выявления мутации.

Какой материал опухоли исследуют?

Для проведения молекулярно-генетического исследования опухоли принимают фиксированный в формальдегиде материал после биопсии опухоли или её метастазов, а также готовые стекла и парафиновые блоки. О деталях процедуры уточнит специалист.

Как исследуют ткань опухоли?

Молекулярно-генетическое тестирование начинается с забора материала - биопсии. Врач-патоморфолог изучает ткань. Для установки “подвида” и выбора верного лечения применяется иммуногистохимическое исследование. При данном методе определенные белки (антитела) реагируют с белками опухоли и дают особую реакцию при окрашивании, что подтверждает вид опухоли.

Для чего применяется FISH-метод?

Флуоресцентная гибридизация in situ (FISH) по особому свечению помогает определить хромосомные аномалии в опухолевых клетках. Данное молекулярно-генетическое исследование применяется для обнаружения мельчайших генетических изменений, недоступных для нахождения иными способами.

Что представляет собой геномное профилирование опухоли?

Геномное профилирование опухоли заключается в “разложении на буквы” (секвенировании) ключевых онкогенов. Технология основана на выявлении генетических мутаций злокачественных клеток. В ходе комплексного профилирования выявляются все нарушения, которые могут быть связаны с онкологическими патологиями, оценивается их значимость.

Что такое таргетная терапия?

Это новое поколение противоопухолевых препаратов, которые атакуют конкретные “мишени”, запускающие опухолевый процесс. Лекарства действуют на пораженные клетки, не трогая здоровые. Для подбора терапии необходимо генетическое тестирование опухоли.

Можно ли назначать таргетное лечение без генетического тестирования опухоли?

Применение «таргетных» препаратов, действующих непосредственно на молекулярную мишень в опухолевой клетке, требует обязательного генетического тестирования, определяющих эффективность терапии. Как правило, доступные для атаки “мишени” несут не все опухоли, а лишь часть случаев. Поэтому нужно сначала обнаружить наличие “мишени” в опухоли, и только затем назначать препарат.

Каким пациентам показано исследование опухолевой ткани?

Исследование показано большинству пациентов для качественной диагностики и лечения, а также выбора терапии из нескольких вариантов; В сложных случаях (при затруднении диагностики или без выявленного первичного очага); Пациентам, которым перестало помогать лечение, назначенное ранее; Пациентам с диагностированным раком, для которого нет клинических стандартов лечения.

Если в образце ткани выявлена мутация, что делать далее?

После проведения комплексного молекулярно-генетического исследования, сбора и анализа всей информации и оформления заключения, пациент получит информацию, которая необходима врачу-онкологу для назначения или коррекции терапии с учетом информации о молекулярном и геномном профиле опухоли. Иногда значимых мутаций выявить не удается. Тем не менее, эта информация также будет полезна лечащему врачу при выборе тактики лечения и назначения дополнительных методов диагностики.

Что получает пациент после прохождения молекулярно-генетического исследования опухоли?

Пациент получает врачебное заключение с по генетическим нарушениям и молекулярным биомаркерам его опухоли, рекомендации по потенциально эффективным/неэффективным или токсичным препаратам.

Какую информацию получает врач по результату исследования?

Геномное профилирование опухоли позволяет врачу персонализировать лечение и получить результат лучше, чем стандартное лечение. Онкогенотест также помогает снизить риск осложнений при лечении и исключить неэффективные в конкретном случае препараты.

Помогают ли методы для прогноза текущего лечения и вероятности рецидива?

Конечно. Генетическое тестирование опухоли помогает выявить персональные риски и скорректировать текущее лечение в случае его неэффективности. После тестирования пациент узнает, повышен ли у него риск повторного заболевания, в каком органе, какие меры профилактики необходимо предпринять.

В чем преимущества геномного тестирования опухоли?

Геномное тестирование позволяет врачу-онкологу назначать эффективную терапию индивидуально для каждого пациента. Классическое назначение лекарств не уточняет персональный "вид" опухоли, а назначается или эмпирически, или "атакует" все клетки организма разом. Тестирование позволяет врачу опираться не на чаще назначаемые при данной патологии препараты, а выбирать препараты, которые при наличии мутации дадут положительный эффект.

Есть ли необходимость в сдаче крови?

Исследования на основе периферической крови возможны в том случае, если тканевая биопсия невозможна, количество опухолевой ткани является недостаточным для анализа или есть подозрения на метастазирование и прогрессирование. В таком случае производится геномное профилирование опухоли на основе образца крови. Также на основе крови осуществляется поиск наследственных и приобретенных мутаций для предупреждения заболевания.

Кому показан онкогенотест без наличия обнаруженной опухоли?

Онкогенотест важен для раннего выявления наследственных форм рака. Также тест будет важен лицам, перенесшим заболевание раннее или имеющим пороки развития. Не стоит забывать, что мутации могут возникать спонтанно в течении жизни, поэтому их раннее обнаружение позволяет не пропустить начало заболевания.

При генетическом тестировании целиком разбирается весь ген?

При генетическом тестировании исследуют только определенные участки генов, которые чаще всего "замечены" в наличии значимых мутаций. Нет необходимости "разбирать" ген целиком, так как цена исследования будет значительно выше, скорость выполнения дольше, а клиническая ценность остается сомнительной.

Существует ли возможность узнать свою предрасположенность к развитию опухолей?

Часть случаев рака имеют наследственную природу. Это значит, что человек унаследовал сломанный ген, повышающий риск заболевания. Геномное профилирование опухоли определяет наличие онкологической предрасположенности и заблаговременно проводит профилактические мероприятия по раннему выявлению опухоли здоровым людям с неблагоприятной наследственностью в генах, вовлеченных в канцерогенез.

Как генетическое тестирование выявляет предрасположенность к наследственным формам рака?

Тест проверяет известные гены, защищающие нас от рака, на наличие мутаций, и определяет риск появления заболевания. Часть случаев рака имеют наследственную природу.

Чем поможет раннее выявление предрасположенности к наследственным формам рака?

Предупрежден - значит вооружен. Зная о своей предрасположенности к развитию опухоли, пациент может взять контроль над здоровьем в свои руки. Генетическое тестирование помогает определить, на какой орган следует обратить внимание. Пациенту рекомендуется прохождение осмотров, ведение здорового образа жизни, соблюдение рекомендаций.

Стоит ли родственникам проходить генетическое тестирование при обнаружении у пациента опухоли?

Единственный способ узнать о существовании мутации у человека - пройти генетическое тестирование самому. Иногда одним и тем же типом рака чаще, чем обычно, заболевают члены одной семьи. Это так называемые семейные формы рака. Проверка носительства этой мутации поможет снизить семейные риски.

Какой рак чаще всего является наследуемым?

Всего известно около девяти распространенных и множество редких онкологических заболеваний, вероятность развития которых увеличена у носителей наследственных мутации. К самым распространенным наследуемым формам относятся рак желудка, яичников, молочной, поджелудочной, щитовидной и предстательной желез, колоректальный рак, меланома.

Что позволяет заподозрить наследственную форму рака?

Можно задуматься о наследственной форме рака при возникновении нескольких случаев одного типа рака в семье. Также насторожить может возникновение рака в каждом из парных органов, или рак, нехарактерный для данного пола. Опухоль появляется чаще всего в более раннем возрасте, чем при "спонтанной" мутации. Несколько типов рака у родственника также могут помочь заподозрить наследственную форму.

Если у родителей нет онкологии, значит и у ребенка не будет наследуемого рака?

Это невозможно сказать однозначно. Родители могут являться здоровыми носителями мутаций, которые ребенок может получить. Более того, даже при получении мутаций, сказать, проявится ли заболевание - невозможно. Большая часть опухолей появляется из-за мутаций, возникающих в течение жизни. Тем не менее, для людей, у которых есть основания опасаться наследственной формы рака, информация будет полезна для соблюдения образа жизни и предотвращения развития заболевания, или же его скорейшего обнаружения.

Как мне может помочь расширенное генетическое исследование ONCOGENOTEST?

Исследование ONCOGENOTEST позволяет определить генетический профиль опухоли и на его основе подобрать персонализированную терапию и оценить прогноз развития заболевания. Включает секвенирование 411 генов, анализ TMB и широкую панель ИГХ.

Такой подход к лечению называется персонализированной медициной, поскольку он основан на вашем уникальном геномном профиле и типе рака. Исследование ONCOGENOTEST может помочь вашему врачу назначить таргетную терапию, иммунотерапию и химиотерапию, которая подходит именно вам.

Список литературы

Wishart DS. Is Cancer a Genetic Disease or a Metabolic Disease?. EBioMedicine. 2015;2(6):478 479. Published 2015 May 23. doi:10.1016/j.ebiom.2015.05.022

K.V. Shelekhova, A.S. Konstantinov.Morphological methods of malignant tumors investigation. Практическая онкология. Т. 18, No4 - 2017

Vnencak-Jones, C., M. Berger, W. Pao. 2016. Types of Molecular Tumor Testing. My Cancer Genome

Sokolenko AP, Imyanitov EN. Molecular Diagnostics in Clinical Oncology. Front Mol Biosci. 2018;5:76. Published 2018 Aug 27. doi:10.3389/fmolb.2018.00076

Эксперт Группы Онкология, врач-онколог, химиотерапевт, к.м.н., заведующая отделением противоопухолевой и лекарственной терапии МЕДСИ

ОНКОКАРТА

"Знай своего врага" - писал Сунь Цзы в книге "Искусство войны". Изучение истории болезни пациента, анализ генов, мутаций и биомаркеров опухоли позволяют узнать о болезни больше и выбрать правильное лечение. Мы предлагаем индивидуальные эффективные меры борьбы с раком.

Каждая опухоль обладает уникальным молекулярным профилем

Две опухоли молочных желез могут отличаться друг от друга сильней, чем опухоли груди и яичников. Опухоль одного пациента не похожа на опухоль другого, поскольку они имеют различный молекулярно-генетический профиль.

ОнкоКарта — это молекулярный профиль опухоли, позволяющий разработать персональный план лечения для каждого пациента.

Что такое ОнкоКарта?

ОнкоКарта - это первый интегративный онкологический тест, который применяется для полной молекулярной диагностики всех потенциально значимых опухолевых генов в комбинации с классическим патогистологическим исследованием опухоли и оценкой влияния обнаруженных отклонений на сигнальные пути, опосредующие развитие опухоли.

ОнкоКарта включает в себя наиболее значимые гены, связанные с направленным лечением опухоли при помощи существующих в настоящее время на рынке лекарственных препаратов.

Из чего состоит ОнкоКарта?

Исследование ОНКОКАРТА состоит из нескольких шагов:

Определение мутационного профиля опухоли;
Анализ обнаруженных мутаций с точки зрения их влияния на эффективность противоопухолевой терапии;
Приоритизация лекарственных препаратов с учетом молекулярного профиля опухоли;
Выдача заключения пациенту.

Опухоли, которые возникают в одном и том же органе, могут быть совершенно разными на молекулярном уровне. Выявление молекулярных особенностей каждой опухоли может быть ключом к правильному ее лечению.

Используемая в лаборатории система анализа ДНК для выявления мутаций в онкогенах позволяет обнаружить мутации при 5% доле мутантного аллеля в образце. Технология основана на методе высокопроизводительного секвенирования ДНК (Next Generation Sequencing, NGS).

Экспертный анализ выявленных в опухоли мутаций может помочь врачу в выборе правильного препарата для лечения.

Молекулярное исследование биомаркеров

Статистика и цифры

Исследования показывают, что после того, как перестаёт помогать первый предложенный вариант лечения, клетки опухоли зачастую также вырабатывают устойчивость к другим лекарственным препаратам. Молекулярная диагностика позволяет изначально выбрать действенный способ лечения.

Достоверная информация

Определенные мутации в онкогенах могут вызывать резистентность опухоли к той или иной терапии. Молекулярный анализ опухоли позволяет заранее предсказать, будет ли эффективен тот или иной лекарственный препарат. Врач, имеющий достоверные данные о наличии мутаций в опухоли, имеет возможность разработать индивидуальную стратегию лечения.

Успешные результаты

9 различных центров провели исследования, направленные на то, чтобы выявить онкомаркеры и выбрать наиболее подходящую терапию для лечения резистентных опухолей, практически не поддающихся лечению. В 27 % случаев при лечении помогли методы, которые не относятся к общепринятым. Терапия прошла успешно и без рецидивов.

Вариант лечения рака

Основные этапы анализа

Мы проводим полный патогистологический и молекулярный анализ, включающий в себя:

Как сделать анализ?

Закажите набор для самостоятельного сбора материала либо посетите медицинский центр «Геномед». При любом способе заказа и на всех этапах прохождения теста вся информация защищена

Клинически значимые гены, входящие в исследование

Результат исследования

В результате исследования лечащему врачу предоставляется интегративное заключение, которое включает несколько частей:

Все клинически значимые молекулярные изменения, обнаруженные в исследуемой опухоли.
Информация о противоопухолевых лекарственных препаратах и предсказание их эффективности на основе анализа выявленных молекулярных изменений.
Ссылки на соответствующие литературные источники.

Что нужно для исследования

Парафиновые блоки со стеклами (образец опухоли). Парафиновые блоки после исследования возвращаются.
Направление врача, выписка из истории болезни с диагнозом.

Как заказать исследование ОнкоКарта

Свяжитесь с нами по телефону, электронной почте, через сайт или через лечащего врача и получите инструкции по отправке материала.
Мы организуем доставку образцов из любого города России.
Срок выполнения исследования - 21 день.

Центральный офис МГЦ «Геномед»:

107014, г. Москва, ул. Короленко, д. 8
(метро Сокольники)

Выберите свой город

Казань
Калининград
Калуга
Кемерово
Киев
Киров
Комсомольск-на-Амуре
Королев
Кострома
Котельники
Краснодар
Краснознаменск
Красноярск
Курган
Курск

Набережные Челны
Нальчик
Нижневартовск
Нижнекамск
Нижний Ломов
Нижний Новгород
Нижний Тагил
Новокузнецк
Новороссийск
Новосибирск
Нур-Султан

Салехард
Самара
Санкт-Петербург
Саранск
Саратов
Севастополь
Симферополь
Смоленск
Сочи
Ставрополь
Старый Оскол
Стерлитамак
Сургут
Сыктывкар

3020 3019 3018 2917 2762 1691 2734 2752 2833 2834 2835 2836 2837 2838 2839 2840 2841 2842 2843 2844 2845 2846 2847 2848 2849 2853 2854 2855 2856 2857 2858 2859 2861 2862 2863 2864 2866 2867 2868 2869 2870 2871 2872 2873 2875 2876 2877 2878 2879 2880 2881 2882 2883 2885 2886 2887 2892 2893 2894 2895 2896 2897 2898 2899 2900 2901 2902 2903 2904 2905 2951 2955 2956 1678 1693 2749 2753 2754 2755 2756 2757 2758 2759 2760 2761 2763 2765 2766 2767 2769 2770 прием только для взрослых;
ул. Б.Бикбая 29А (KDL)
прием для взрослых и детей до 14лет ">2771 2772 2773 2774 2775 2776 2777 2778 2779 2780 2781 2782 2783 2784 2785 2786 2787 2788 2789 2790 2791 2792 2793 2795 2798 2799 2800 2801 2802 2803 2804 2805 2806 2807 2808

Выберите удобный
способ связи

Спасибо,
что выбрали «Геномед»

Сотрудник клиентского сервиса свяжется с Вами в течение 30 минут для подтверждения

Читайте также: